Το ΕΚΕΦΕ Δημόκριτος είναι συντονιστής σε τρεις Εθνικές Ερευνητικές Υποδομές και συμμετέχει σε άλλες εφτά. Οι υποδομές αυτές προσφέρουν υψηλού επιπέδου υπηρεσίες στην ερευνητική κοινότητα, υποστηρίζουν τις ευρωπαϊκές πολιτικές για την ανοιχτή επιστήμη και επιτρέπουν πρόσβαση σε επιχειρήσεις που επιδιώκουν να καινοτομήσουν με βάση την πρωτόγνωρη εργαστηριακή ισχύ που αυτές οι συνεργατικές υποδομές παρέχουν. Ο προϋπολογισμός που θα επενδυθεί σε εξοπλισμό και εξειδικευμένο προσωπικό στις παραπάνω υποδομές για την περίοδο 2018-2021 είναι περίπου οχτώ εκατομμύρια ευρώ.
Εθνική υποδομή Νανοτεχνολογίας, Προηγμένων Υλικών και Μικρο-/Νανοηλεκτρονικής
Integrated Energy Chain
Integrated Structural Biology, Drug Screening Efforts & Drug target functional characterization
Πανελλαδική Υποδομή για τη μελέτη της ατμοσφαιρικής σύστασης και κλιματικής αλλαγής
Shipping Transport and Logistics
High Energy Physics Detector
Ελληνική Ερευνητική Υποδομή για την απεικόνιση και παρακολούθηση θεμελιωδών διεργασιών στην Βιολογία και Ιατρική