Το Ινστιτούτο Βιοεπιστημών και Εφαρμογών έχει ως αποστολή τη διεξαγωγή υψηλού επιπέδου βασικής και εφαρμοσμένης έρευνας στις επιστήμες ζωής και την αξιοποίηση των ερευνητικών αποτελεσμάτων. Ιδιαίτερα εστιάζει: i) στη ρύθμιση κυτταρικών λειτουργιών και στους μοριακούς μηχανισμούς σε φυσιολογικές και παθολογικές καταστάσεις, ii) στο περιβάλλον και στη βιοτεχνολογία, iii) στη δομική και υπολογιστική βιολογία, καθώς και σε τομείς συναφείς με τις παραπάνω κατευθύνσεις.

Το ΙΒΕ δίνει έμφαση στην προώθηση της αριστείας και της καινοτομίας και αποσκοπεί: i) στην παραγωγή νέας γνώσης, ii) στην ανάπτυξη και στην αξιολόγηση βιοδραστικών ενώσεων, προϊόντων και καινοτόμων τεχνολογιών για πρόληψη, διάγνωση και θεραπεία νοσημάτων, καθώς και βιοτεχνολογικών εφαρμογών σχετιζόμενων με την υγεία, το περιβάλλον και την αγροδιατροφή, iii) στην εκπαίδευση και κατάρτιση νέων επιστημόνων, iv) στη διάχυση της επιστημονικής γνώσης στην κοινωνία και v) στην παροχή εξειδικευμένων ερευνητικών και τεχνολογικών υπηρεσιών και προϊόντων καθώς και στη μεταφορά τεχνογνωσίας σε φορείς του δημόσιου και ιδιωτικού τομέα.

Για τις σχέσεις του ΙΒΕ με το εξωτερικό χρησιμοποιείται η επωνυμία Institute of Biosciences and Applications με ακρωνύμιο IBA. To IBE συμμετέχει στο εκπαιδευτικό πρόγραμμα του ΕΚΕΦΕ «Δ» στους τομείς που εμπίπτουν στις ερευνητικές και αναπτυξιακές του δραστηριότητες.